В детстве одна девочка стала свидетелем невероятного, что определило её судьбу раз и навсегда. Последующие двадцать лет она потратила в поисках самой засекреченной правительственной организации, стоящей на страже человечества от всевозможных угроз из открытого космоса и оберегающей людей от ноши знания о существовании иных форм жизни, - Люди в чёрном. После немыслимого количества неудачных попыток ей удаётся найти замаскированную штаб-квартиру организации и встретиться с управляющей ею агентом О.
Девушка получает работу мечты и прошлое стёрто, теперь она агент М. Новенькой поручают отправиться в британское подразделение Людей в чёрном и работать в команде с агентом Эйч - разгильдяем и её полной противоположностью, которые, между делом, отлично справляется со своими обязанностями и может надрать зад любому посягнувшему на нашу планету инопланетянину. Люди в чёрном прошли через множество испытаний и угроз конца света за свою долгую историю, но они ещё никогда не сталкивались с врагом такого уровня и доступа к их информации - вражеским кротом, засланным в ряды Людей в чёрном с самыми злыми намерениями.